Da um 1170 in dem neuen Stadtteil die Nicolaikirche erbaut und vermutlich bald Pfarrkirche wurde, wurde die Martinskirche nur noch als Kapelle genutzt. Bei der Kapelle wurden das St. Martin- und später (1521 - 1526) das St. Gertruds-Hospital errichtet. Im Dreißigjährigen Krieg ist das St. Martins-Hospital dann abgebrochen worden. Auf dem Kirchhof fanden, wie heute noch, die Beerdigungen für die Stadt statt.
Von der alten Kirche ist jetzt nur noch der Chor und die Apsis erhalten. Das baufällige Schiff ist 1866 abgerissen und dafür ein kleineres erbaut worden.